Protein–RNA interactions for Protein: P54578

USP14, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP14P54578 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP14P54578 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP14P54578 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP14P54578 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
USP14P54578 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP14P54578 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
USP14P54578 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP14P54578 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP14P54578 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
USP14P54578 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP14P54578 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP14P54578 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP14P54578 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP14P54578 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP14P54578 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP14P54578 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP14P54578 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP14P54578 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP14P54578 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP14P54578 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP14P54578 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP14P54578 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
USP14P54578 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP14P54578 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP14P54578 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP14P54578 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP14P54578 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP14P54578 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
USP14P54578 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP14P54578 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP14P54578 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP14P54578 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP14P54578 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP14P54578 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP14P54578 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP14P54578 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP14P54578 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
USP14P54578 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP14P54578 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP14P54578 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP14P54578 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP14P54578 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP14P54578 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP14P54578 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP14P54578 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP14P54578 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP14P54578 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
USP14P54578 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP14P54578 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP14P54578 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP14P54578 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP14P54578 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP14P54578 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP14P54578 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP14P54578 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP14P54578 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP14P54578 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP14P54578 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
USP14P54578 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP14P54578 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
USP14P54578 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP14P54578 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
USP14P54578 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP14P54578 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP14P54578 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
USP14P54578 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP14P54578 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
USP14P54578 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP14P54578 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP14P54578 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP14P54578 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP14P54578 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP14P54578 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP14P54578 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP14P54578 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP14P54578 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP14P54578 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP14P54578 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP14P54578 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP14P54578 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP14P54578 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP14P54578 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP14P54578 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP14P54578 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP14P54578 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP14P54578 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP14P54578 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP14P54578 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP14P54578 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP14P54578 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP14P54578 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP14P54578 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP14P54578 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP14P54578 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP14P54578 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP14P54578 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP14P54578 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP14P54578 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP14P54578 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP14P54578 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms