Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATXN1P54253 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATXN1P54253 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATXN1P54253 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATXN1P54253 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATXN1P54253 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATXN1P54253 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATXN1P54253 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATXN1P54253 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATXN1P54253 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATXN1P54253 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATXN1P54253 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATXN1P54253 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATXN1P54253 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms