Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATXN3P54252 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATXN3P54252 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATXN3P54252 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATXN3P54252 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATXN3P54252 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATXN3P54252 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATXN3P54252 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATXN3P54252 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATXN3P54252 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATXN3P54252 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATXN3P54252 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATXN3P54252 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATXN3P54252 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATXN3P54252 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATXN3P54252 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATXN3P54252 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATXN3P54252 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATXN3P54252 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATXN3P54252 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATXN3P54252 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATXN3P54252 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATXN3P54252 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATXN3P54252 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATXN3P54252 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATXN3P54252 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATXN3P54252 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATXN3P54252 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATXN3P54252 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATXN3P54252 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATXN3P54252 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATXN3P54252 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATXN3P54252 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATXN3P54252 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATXN3P54252 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATXN3P54252 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATXN3P54252 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATXN3P54252 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATXN3P54252 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATXN3P54252 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATXN3P54252 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATXN3P54252 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATXN3P54252 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATXN3P54252 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATXN3P54252 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATXN3P54252 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATXN3P54252 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATXN3P54252 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ATXN3P54252 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATXN3P54252 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATXN3P54252 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms