Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPAP53621 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPAP53621 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPAP53621 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
COPAP53621 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPAP53621 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPAP53621 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPAP53621 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPAP53621 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPAP53621 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPAP53621 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPAP53621 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPAP53621 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COPAP53621 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COPAP53621 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPAP53621 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPAP53621 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPAP53621 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPAP53621 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPAP53621 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPAP53621 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPAP53621 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPAP53621 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPAP53621 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPAP53621 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPAP53621 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPAP53621 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPAP53621 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPAP53621 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPAP53621 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPAP53621 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPAP53621 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPAP53621 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
COPAP53621 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPAP53621 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPAP53621 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPAP53621 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPAP53621 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPAP53621 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPAP53621 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPAP53621 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPAP53621 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPAP53621 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPAP53621 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPAP53621 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPAP53621 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPAP53621 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPAP53621 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPAP53621 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPAP53621 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPAP53621 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
COPAP53621 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
COPAP53621 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPAP53621 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
COPAP53621 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
COPAP53621 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPAP53621 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
COPAP53621 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPAP53621 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPAP53621 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPAP53621 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPAP53621 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPAP53621 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPAP53621 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPAP53621 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPAP53621 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPAP53621 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPAP53621 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPAP53621 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPAP53621 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPAP53621 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPAP53621 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPAP53621 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPAP53621 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPAP53621 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPAP53621 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPAP53621 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPAP53621 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPAP53621 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPAP53621 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPAP53621 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPAP53621 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPAP53621 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPAP53621 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPAP53621 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPAP53621 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPAP53621 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPAP53621 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPAP53621 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPAP53621 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPAP53621 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPAP53621 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPAP53621 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPAP53621 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPAP53621 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPAP53621 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPAP53621 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPAP53621 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPAP53621 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPAP53621 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms