Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GBX2P52951 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GBX2P52951 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GBX2P52951 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBX2P52951 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBX2P52951 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBX2P52951 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBX2P52951 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBX2P52951 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBX2P52951 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBX2P52951 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBX2P52951 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBX2P52951 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBX2P52951 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GBX2P52951 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GBX2P52951 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
GBX2P52951 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GBX2P52951 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GBX2P52951 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GBX2P52951 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GBX2P52951 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GBX2P52951 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GBX2P52951 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GBX2P52951 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GBX2P52951 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GBX2P52951 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GBX2P52951 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GBX2P52951 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GBX2P52951 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GBX2P52951 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GBX2P52951 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GBX2P52951 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GBX2P52951 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GBX2P52951 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GBX2P52951 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GBX2P52951 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GBX2P52951 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GBX2P52951 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GBX2P52951 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GBX2P52951 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GBX2P52951 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GBX2P52951 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GBX2P52951 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GBX2P52951 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GBX2P52951 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GBX2P52951 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GBX2P52951 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GBX2P52951 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GBX2P52951 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GBX2P52951 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GBX2P52951 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GBX2P52951 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBX2P52951 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBX2P52951 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBX2P52951 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBX2P52951 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBX2P52951 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBX2P52951 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBX2P52951 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBX2P52951 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBX2P52951 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBX2P52951 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBX2P52951 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBX2P52951 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBX2P52951 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBX2P52951 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBX2P52951 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBX2P52951 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBX2P52951 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBX2P52951 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBX2P52951 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBX2P52951 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBX2P52951 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBX2P52951 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBX2P52951 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBX2P52951 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBX2P52951 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBX2P52951 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GBX2P52951 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBX2P52951 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBX2P52951 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBX2P52951 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBX2P52951 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBX2P52951 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBX2P52951 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GBX2P52951 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GBX2P52951 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GBX2P52951 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GBX2P52951 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GBX2P52951 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GBX2P52951 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GBX2P52951 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GBX2P52951 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GBX2P52951 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GBX2P52951 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GBX2P52951 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GBX2P52951 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GBX2P52951 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GBX2P52951 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GBX2P52951 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms