Protein–RNA interactions for Protein: P52849

NDST2, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST2P52849 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NDST2P52849 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDST2P52849 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDST2P52849 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDST2P52849 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDST2P52849 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDST2P52849 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDST2P52849 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDST2P52849 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDST2P52849 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDST2P52849 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDST2P52849 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDST2P52849 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDST2P52849 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDST2P52849 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDST2P52849 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDST2P52849 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDST2P52849 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDST2P52849 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDST2P52849 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NDST2P52849 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDST2P52849 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDST2P52849 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDST2P52849 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NDST2P52849 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDST2P52849 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDST2P52849 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NDST2P52849 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NDST2P52849 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDST2P52849 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NDST2P52849 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDST2P52849 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDST2P52849 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDST2P52849 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDST2P52849 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDST2P52849 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDST2P52849 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDST2P52849 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDST2P52849 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDST2P52849 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NDST2P52849 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDST2P52849 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDST2P52849 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDST2P52849 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDST2P52849 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDST2P52849 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDST2P52849 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NDST2P52849 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDST2P52849 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDST2P52849 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDST2P52849 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDST2P52849 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDST2P52849 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDST2P52849 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDST2P52849 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDST2P52849 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDST2P52849 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDST2P52849 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDST2P52849 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDST2P52849 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDST2P52849 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDST2P52849 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDST2P52849 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDST2P52849 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDST2P52849 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDST2P52849 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDST2P52849 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDST2P52849 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDST2P52849 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDST2P52849 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDST2P52849 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDST2P52849 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDST2P52849 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDST2P52849 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDST2P52849 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDST2P52849 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDST2P52849 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDST2P52849 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDST2P52849 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDST2P52849 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDST2P52849 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDST2P52849 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDST2P52849 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDST2P52849 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDST2P52849 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NDST2P52849 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDST2P52849 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDST2P52849 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NDST2P52849 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDST2P52849 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDST2P52849 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDST2P52849 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDST2P52849 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDST2P52849 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDST2P52849 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDST2P52849 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDST2P52849 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDST2P52849 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDST2P52849 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NDST2P52849 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms