Protein–RNA interactions for Protein: P52735

VAV2, Guanine nucleotide exchange factor VAV2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV2P52735 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VAV2P52735 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VAV2P52735 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
VAV2P52735 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
VAV2P52735 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
VAV2P52735 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
VAV2P52735 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VAV2P52735 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VAV2P52735 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VAV2P52735 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAV2P52735 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAV2P52735 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAV2P52735 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAV2P52735 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAV2P52735 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAV2P52735 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAV2P52735 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
VAV2P52735 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAV2P52735 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAV2P52735 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAV2P52735 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAV2P52735 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAV2P52735 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAV2P52735 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAV2P52735 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAV2P52735 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAV2P52735 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAV2P52735 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAV2P52735 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
VAV2P52735 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAV2P52735 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAV2P52735 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAV2P52735 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAV2P52735 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAV2P52735 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAV2P52735 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAV2P52735 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAV2P52735 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAV2P52735 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAV2P52735 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
VAV2P52735 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAV2P52735 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAV2P52735 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAV2P52735 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAV2P52735 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAV2P52735 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAV2P52735 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAV2P52735 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAV2P52735 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAV2P52735 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
VAV2P52735 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAV2P52735 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAV2P52735 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAV2P52735 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAV2P52735 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAV2P52735 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAV2P52735 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAV2P52735 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAV2P52735 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAV2P52735 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
VAV2P52735 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAV2P52735 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAV2P52735 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAV2P52735 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAV2P52735 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAV2P52735 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAV2P52735 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAV2P52735 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAV2P52735 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAV2P52735 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAV2P52735 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAV2P52735 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAV2P52735 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAV2P52735 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAV2P52735 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAV2P52735 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAV2P52735 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAV2P52735 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAV2P52735 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAV2P52735 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAV2P52735 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAV2P52735 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAV2P52735 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAV2P52735 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAV2P52735 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAV2P52735 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAV2P52735 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAV2P52735 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAV2P52735 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAV2P52735 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAV2P52735 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAV2P52735 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAV2P52735 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAV2P52735 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAV2P52735 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAV2P52735 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAV2P52735 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAV2P52735 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAV2P52735 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAV2P52735 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms