Protein–RNA interactions for Protein: P51688

SGSH, N-sulphoglucosamine sulphohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSHP51688 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGSHP51688 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGSHP51688 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGSHP51688 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGSHP51688 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGSHP51688 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGSHP51688 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGSHP51688 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGSHP51688 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGSHP51688 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGSHP51688 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGSHP51688 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SGSHP51688 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGSHP51688 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGSHP51688 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGSHP51688 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGSHP51688 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGSHP51688 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGSHP51688 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SGSHP51688 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGSHP51688 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SGSHP51688 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGSHP51688 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGSHP51688 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGSHP51688 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGSHP51688 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGSHP51688 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGSHP51688 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGSHP51688 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGSHP51688 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SGSHP51688 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SGSHP51688 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGSHP51688 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGSHP51688 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGSHP51688 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSHP51688 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSHP51688 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSHP51688 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSHP51688 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSHP51688 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSHP51688 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGSHP51688 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGSHP51688 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGSHP51688 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGSHP51688 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGSHP51688 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGSHP51688 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGSHP51688 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGSHP51688 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGSHP51688 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGSHP51688 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGSHP51688 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGSHP51688 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGSHP51688 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGSHP51688 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGSHP51688 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGSHP51688 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SGSHP51688 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGSHP51688 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGSHP51688 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGSHP51688 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SGSHP51688 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SGSHP51688 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGSHP51688 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SGSHP51688 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SGSHP51688 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SGSHP51688 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SGSHP51688 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGSHP51688 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGSHP51688 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGSHP51688 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGSHP51688 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGSHP51688 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SGSHP51688 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGSHP51688 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGSHP51688 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGSHP51688 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGSHP51688 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGSHP51688 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SGSHP51688 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGSHP51688 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGSHP51688 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SGSHP51688 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGSHP51688 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGSHP51688 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGSHP51688 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGSHP51688 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGSHP51688 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGSHP51688 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGSHP51688 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGSHP51688 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGSHP51688 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGSHP51688 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGSHP51688 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGSHP51688 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGSHP51688 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGSHP51688 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGSHP51688 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGSHP51688 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGSHP51688 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms