Protein–RNA interactions for Protein: P51571

SSR4, Translocon-associated protein subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4P51571 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSR4P51571 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SSR4P51571 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSR4P51571 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SSR4P51571 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSR4P51571 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSR4P51571 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SSR4P51571 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSR4P51571 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSR4P51571 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSR4P51571 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSR4P51571 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSR4P51571 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSR4P51571 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSR4P51571 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSR4P51571 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSR4P51571 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSR4P51571 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSR4P51571 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSR4P51571 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSR4P51571 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSR4P51571 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSR4P51571 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSR4P51571 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSR4P51571 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSR4P51571 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSR4P51571 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSR4P51571 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSR4P51571 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSR4P51571 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSR4P51571 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSR4P51571 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SSR4P51571 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSR4P51571 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SSR4P51571 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSR4P51571 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSR4P51571 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSR4P51571 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SSR4P51571 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSR4P51571 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSR4P51571 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSR4P51571 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSR4P51571 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSR4P51571 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSR4P51571 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSR4P51571 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSR4P51571 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSR4P51571 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSR4P51571 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSR4P51571 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSR4P51571 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSR4P51571 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSR4P51571 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSR4P51571 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSR4P51571 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSR4P51571 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSR4P51571 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSR4P51571 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSR4P51571 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSR4P51571 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSR4P51571 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSR4P51571 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSR4P51571 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSR4P51571 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSR4P51571 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSR4P51571 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSR4P51571 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSR4P51571 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSR4P51571 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSR4P51571 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSR4P51571 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SSR4P51571 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSR4P51571 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSR4P51571 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSR4P51571 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSR4P51571 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SSR4P51571 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSR4P51571 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSR4P51571 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSR4P51571 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSR4P51571 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSR4P51571 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSR4P51571 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSR4P51571 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSR4P51571 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSR4P51571 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSR4P51571 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSR4P51571 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSR4P51571 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSR4P51571 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSR4P51571 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSR4P51571 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSR4P51571 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSR4P51571 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSR4P51571 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSR4P51571 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSR4P51571 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSR4P51571 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSR4P51571 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSR4P51571 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms