Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PAPOLAP51003 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAPOLAP51003 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms