Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP1A2P50993 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP1A2P50993 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP1A2P50993 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP1A2P50993 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP1A2P50993 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP1A2P50993 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP1A2P50993 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP1A2P50993 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP1A2P50993 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP1A2P50993 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP1A2P50993 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP1A2P50993 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP1A2P50993 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP1A2P50993 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP1A2P50993 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP1A2P50993 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP1A2P50993 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP1A2P50993 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP1A2P50993 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP1A2P50993 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP1A2P50993 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP1A2P50993 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP1A2P50993 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP1A2P50993 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP1A2P50993 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP1A2P50993 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP1A2P50993 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP1A2P50993 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP1A2P50993 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP1A2P50993 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP1A2P50993 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP1A2P50993 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP1A2P50993 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP1A2P50993 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.5 ms