Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK7P50613 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK7P50613 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK7P50613 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK7P50613 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK7P50613 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK7P50613 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK7P50613 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK7P50613 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK7P50613 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK7P50613 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK7P50613 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK7P50613 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK7P50613 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK7P50613 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK7P50613 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK7P50613 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK7P50613 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK7P50613 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK7P50613 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK7P50613 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK7P50613 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK7P50613 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK7P50613 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK7P50613 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK7P50613 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK7P50613 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK7P50613 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK7P50613 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK7P50613 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK7P50613 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK7P50613 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK7P50613 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK7P50613 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK7P50613 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK7P50613 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK7P50613 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK7P50613 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK7P50613 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK7P50613 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK7P50613 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK7P50613 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK7P50613 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CDK7P50613 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK7P50613 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK7P50613 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK7P50613 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK7P50613 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK7P50613 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK7P50613 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK7P50613 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK7P50613 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK7P50613 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK7P50613 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK7P50613 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK7P50613 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK7P50613 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK7P50613 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK7P50613 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK7P50613 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK7P50613 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK7P50613 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK7P50613 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK7P50613 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK7P50613 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK7P50613 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK7P50613 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK7P50613 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK7P50613 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK7P50613 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK7P50613 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK7P50613 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK7P50613 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK7P50613 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK7P50613 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK7P50613 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK7P50613 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDK7P50613 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDK7P50613 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDK7P50613 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDK7P50613 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDK7P50613 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK7P50613 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK7P50613 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK7P50613 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK7P50613 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK7P50613 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK7P50613 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK7P50613 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK7P50613 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK7P50613 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK7P50613 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK7P50613 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK7P50613 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK7P50613 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK7P50613 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK7P50613 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK7P50613 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK7P50613 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK7P50613 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.2 ms