Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IDH3AP50213 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IDH3AP50213 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IDH3AP50213 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IDH3AP50213 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IDH3AP50213 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IDH3AP50213 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IDH3AP50213 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IDH3AP50213 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IDH3AP50213 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IDH3AP50213 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
IDH3AP50213 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IDH3AP50213 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IDH3AP50213 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
IDH3AP50213 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IDH3AP50213 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IDH3AP50213 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IDH3AP50213 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IDH3AP50213 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IDH3AP50213 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IDH3AP50213 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IDH3AP50213 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IDH3AP50213 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms