Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MRE11P49959 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MRE11P49959 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MRE11P49959 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MRE11P49959 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MRE11P49959 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MRE11P49959 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MRE11P49959 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MRE11P49959 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MRE11P49959 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MRE11P49959 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MRE11P49959 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MRE11P49959 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MRE11P49959 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MRE11P49959 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MRE11P49959 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MRE11P49959 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MRE11P49959 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MRE11P49959 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MRE11P49959 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MRE11P49959 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MRE11P49959 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MRE11P49959 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MRE11P49959 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MRE11P49959 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MRE11P49959 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MRE11P49959 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MRE11P49959 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MRE11P49959 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MRE11P49959 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MRE11P49959 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MRE11P49959 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MRE11P49959 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MRE11P49959 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MRE11P49959 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MRE11P49959 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MRE11P49959 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MRE11P49959 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MRE11P49959 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MRE11P49959 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MRE11P49959 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MRE11P49959 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MRE11P49959 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MRE11P49959 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MRE11P49959 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MRE11P49959 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MRE11P49959 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MRE11P49959 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MRE11P49959 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MRE11P49959 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MRE11P49959 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MRE11P49959 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MRE11P49959 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MRE11P49959 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MRE11P49959 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MRE11P49959 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MRE11P49959 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MRE11P49959 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MRE11P49959 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MRE11P49959 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MRE11P49959 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MRE11P49959 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MRE11P49959 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MRE11P49959 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MRE11P49959 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MRE11P49959 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MRE11P49959 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MRE11P49959 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MRE11P49959 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MRE11P49959 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MRE11P49959 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MRE11P49959 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MRE11P49959 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MRE11P49959 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MRE11P49959 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MRE11P49959 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MRE11P49959 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MRE11P49959 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MRE11P49959 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MRE11P49959 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MRE11P49959 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MRE11P49959 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MRE11P49959 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MRE11P49959 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MRE11P49959 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MRE11P49959 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MRE11P49959 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MRE11P49959 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MRE11P49959 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MRE11P49959 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MRE11P49959 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MRE11P49959 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MRE11P49959 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MRE11P49959 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MRE11P49959 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MRE11P49959 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MRE11P49959 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MRE11P49959 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MRE11P49959 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MRE11P49959 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms