Protein–RNA interactions for Protein: P49757

NUMB, Protein numb homolog, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUMBP49757 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUMBP49757 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NUMBP49757 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUMBP49757 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUMBP49757 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUMBP49757 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUMBP49757 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUMBP49757 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUMBP49757 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUMBP49757 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUMBP49757 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUMBP49757 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUMBP49757 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUMBP49757 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUMBP49757 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUMBP49757 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUMBP49757 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUMBP49757 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUMBP49757 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUMBP49757 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUMBP49757 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUMBP49757 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUMBP49757 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUMBP49757 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NUMBP49757 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NUMBP49757 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUMBP49757 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUMBP49757 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUMBP49757 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUMBP49757 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUMBP49757 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUMBP49757 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUMBP49757 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUMBP49757 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUMBP49757 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUMBP49757 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUMBP49757 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUMBP49757 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUMBP49757 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUMBP49757 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUMBP49757 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUMBP49757 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUMBP49757 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUMBP49757 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUMBP49757 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUMBP49757 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUMBP49757 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NUMBP49757 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUMBP49757 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUMBP49757 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUMBP49757 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUMBP49757 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUMBP49757 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NUMBP49757 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUMBP49757 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NUMBP49757 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUMBP49757 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUMBP49757 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NUMBP49757 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUMBP49757 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUMBP49757 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUMBP49757 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NUMBP49757 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUMBP49757 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUMBP49757 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUMBP49757 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUMBP49757 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUMBP49757 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUMBP49757 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUMBP49757 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUMBP49757 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUMBP49757 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUMBP49757 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUMBP49757 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NUMBP49757 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUMBP49757 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUMBP49757 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUMBP49757 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUMBP49757 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUMBP49757 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUMBP49757 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUMBP49757 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUMBP49757 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUMBP49757 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUMBP49757 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUMBP49757 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUMBP49757 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUMBP49757 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUMBP49757 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUMBP49757 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUMBP49757 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUMBP49757 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUMBP49757 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUMBP49757 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUMBP49757 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUMBP49757 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUMBP49757 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUMBP49757 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUMBP49757 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUMBP49757 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms