Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POU3F4P49335 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms