Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LHX1P48742 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LHX1P48742 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LHX1P48742 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LHX1P48742 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LHX1P48742 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LHX1P48742 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LHX1P48742 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LHX1P48742 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LHX1P48742 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LHX1P48742 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LHX1P48742 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LHX1P48742 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LHX1P48742 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LHX1P48742 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LHX1P48742 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LHX1P48742 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LHX1P48742 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LHX1P48742 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LHX1P48742 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LHX1P48742 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LHX1P48742 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LHX1P48742 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LHX1P48742 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LHX1P48742 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LHX1P48742 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LHX1P48742 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LHX1P48742 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LHX1P48742 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LHX1P48742 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LHX1P48742 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LHX1P48742 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LHX1P48742 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LHX1P48742 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LHX1P48742 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LHX1P48742 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LHX1P48742 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LHX1P48742 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LHX1P48742 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LHX1P48742 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LHX1P48742 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LHX1P48742 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LHX1P48742 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LHX1P48742 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LHX1P48742 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LHX1P48742 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LHX1P48742 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LHX1P48742 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LHX1P48742 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LHX1P48742 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LHX1P48742 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LHX1P48742 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LHX1P48742 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LHX1P48742 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LHX1P48742 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LHX1P48742 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LHX1P48742 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LHX1P48742 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LHX1P48742 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LHX1P48742 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LHX1P48742 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LHX1P48742 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LHX1P48742 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LHX1P48742 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LHX1P48742 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LHX1P48742 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LHX1P48742 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LHX1P48742 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LHX1P48742 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LHX1P48742 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LHX1P48742 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LHX1P48742 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LHX1P48742 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LHX1P48742 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LHX1P48742 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LHX1P48742 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LHX1P48742 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LHX1P48742 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LHX1P48742 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LHX1P48742 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LHX1P48742 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LHX1P48742 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LHX1P48742 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LHX1P48742 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LHX1P48742 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LHX1P48742 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LHX1P48742 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LHX1P48742 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LHX1P48742 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LHX1P48742 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LHX1P48742 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LHX1P48742 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LHX1P48742 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LHX1P48742 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LHX1P48742 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LHX1P48742 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LHX1P48742 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LHX1P48742 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LHX1P48742 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LHX1P48742 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms