Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPZBP47756 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPZBP47756 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPZBP47756 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPZBP47756 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPZBP47756 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPZBP47756 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPZBP47756 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPZBP47756 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPZBP47756 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPZBP47756 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPZBP47756 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPZBP47756 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPZBP47756 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPZBP47756 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPZBP47756 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPZBP47756 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPZBP47756 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPZBP47756 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPZBP47756 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPZBP47756 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPZBP47756 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPZBP47756 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPZBP47756 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms