Protein–RNA interactions for Protein: P43405

SYK, Tyrosine-protein kinase SYK, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYKP43405 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYKP43405 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYKP43405 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYKP43405 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYKP43405 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYKP43405 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYKP43405 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYKP43405 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYKP43405 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYKP43405 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYKP43405 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYKP43405 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYKP43405 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYKP43405 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYKP43405 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYKP43405 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYKP43405 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYKP43405 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYKP43405 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYKP43405 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYKP43405 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYKP43405 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SYKP43405 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYKP43405 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYKP43405 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYKP43405 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYKP43405 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYKP43405 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYKP43405 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYKP43405 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SYKP43405 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYKP43405 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYKP43405 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYKP43405 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYKP43405 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYKP43405 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYKP43405 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYKP43405 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYKP43405 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYKP43405 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYKP43405 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYKP43405 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYKP43405 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYKP43405 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYKP43405 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYKP43405 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYKP43405 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYKP43405 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYKP43405 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYKP43405 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYKP43405 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYKP43405 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYKP43405 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYKP43405 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYKP43405 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYKP43405 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYKP43405 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYKP43405 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SYKP43405 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYKP43405 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYKP43405 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYKP43405 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYKP43405 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYKP43405 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYKP43405 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYKP43405 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYKP43405 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYKP43405 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYKP43405 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYKP43405 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYKP43405 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYKP43405 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYKP43405 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYKP43405 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYKP43405 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYKP43405 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYKP43405 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYKP43405 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SYKP43405 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYKP43405 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYKP43405 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYKP43405 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYKP43405 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYKP43405 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYKP43405 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYKP43405 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SYKP43405 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SYKP43405 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYKP43405 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYKP43405 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYKP43405 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYKP43405 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYKP43405 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYKP43405 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYKP43405 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYKP43405 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYKP43405 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYKP43405 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYKP43405 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYKP43405 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms