Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSR1P43307 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SSR1P43307 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SSR1P43307 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SSR1P43307 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SSR1P43307 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SSR1P43307 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSR1P43307 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSR1P43307 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSR1P43307 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSR1P43307 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSR1P43307 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSR1P43307 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSR1P43307 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSR1P43307 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSR1P43307 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSR1P43307 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSR1P43307 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSR1P43307 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSR1P43307 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSR1P43307 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSR1P43307 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSR1P43307 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SSR1P43307 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSR1P43307 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSR1P43307 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSR1P43307 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSR1P43307 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSR1P43307 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSR1P43307 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSR1P43307 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSR1P43307 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSR1P43307 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSR1P43307 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSR1P43307 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SSR1P43307 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSR1P43307 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSR1P43307 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSR1P43307 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSR1P43307 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSR1P43307 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSR1P43307 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSR1P43307 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSR1P43307 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSR1P43307 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSR1P43307 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSR1P43307 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSR1P43307 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSR1P43307 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSR1P43307 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSR1P43307 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSR1P43307 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSR1P43307 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSR1P43307 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSR1P43307 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSR1P43307 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSR1P43307 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSR1P43307 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSR1P43307 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSR1P43307 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSR1P43307 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSR1P43307 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSR1P43307 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSR1P43307 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSR1P43307 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSR1P43307 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSR1P43307 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSR1P43307 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSR1P43307 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSR1P43307 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSR1P43307 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSR1P43307 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SSR1P43307 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSR1P43307 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSR1P43307 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSR1P43307 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSR1P43307 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSR1P43307 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSR1P43307 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSR1P43307 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SSR1P43307 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SSR1P43307 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SSR1P43307 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSR1P43307 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSR1P43307 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSR1P43307 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSR1P43307 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSR1P43307 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSR1P43307 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SSR1P43307 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSR1P43307 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSR1P43307 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSR1P43307 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSR1P43307 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSR1P43307 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSR1P43307 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSR1P43307 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSR1P43307 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSR1P43307 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSR1P43307 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1544.4 ms