Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GPD2P43304 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPD2P43304 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPD2P43304 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPD2P43304 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPD2P43304 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPD2P43304 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPD2P43304 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPD2P43304 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPD2P43304 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPD2P43304 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPD2P43304 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPD2P43304 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GPD2P43304 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPD2P43304 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPD2P43304 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPD2P43304 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPD2P43304 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPD2P43304 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPD2P43304 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GPD2P43304 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GPD2P43304 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GPD2P43304 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPD2P43304 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPD2P43304 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPD2P43304 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPD2P43304 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPD2P43304 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPD2P43304 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPD2P43304 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPD2P43304 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPD2P43304 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPD2P43304 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPD2P43304 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPD2P43304 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPD2P43304 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPD2P43304 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPD2P43304 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPD2P43304 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPD2P43304 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPD2P43304 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPD2P43304 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPD2P43304 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPD2P43304 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPD2P43304 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPD2P43304 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GPD2P43304 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPD2P43304 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPD2P43304 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPD2P43304 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPD2P43304 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPD2P43304 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPD2P43304 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPD2P43304 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPD2P43304 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPD2P43304 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPD2P43304 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPD2P43304 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPD2P43304 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPD2P43304 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPD2P43304 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPD2P43304 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPD2P43304 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPD2P43304 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPD2P43304 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPD2P43304 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPD2P43304 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GPD2P43304 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPD2P43304 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPD2P43304 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPD2P43304 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPD2P43304 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GPD2P43304 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPD2P43304 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GPD2P43304 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPD2P43304 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPD2P43304 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPD2P43304 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPD2P43304 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPD2P43304 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPD2P43304 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPD2P43304 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPD2P43304 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPD2P43304 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPD2P43304 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPD2P43304 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPD2P43304 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPD2P43304 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GPD2P43304 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GPD2P43304 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GPD2P43304 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPD2P43304 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPD2P43304 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPD2P43304 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPD2P43304 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GPD2P43304 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPD2P43304 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPD2P43304 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPD2P43304 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPD2P43304 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms