Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC1A4P43007 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC1A4P43007 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC1A4P43007 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC1A4P43007 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC1A4P43007 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC1A4P43007 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC1A4P43007 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC1A4P43007 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC1A4P43007 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC1A4P43007 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC1A4P43007 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC1A4P43007 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC1A4P43007 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC1A4P43007 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC1A4P43007 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC1A4P43007 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC1A4P43007 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC1A4P43007 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC1A4P43007 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC1A4P43007 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC1A4P43007 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC1A4P43007 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC1A4P43007 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC1A4P43007 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC1A4P43007 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC1A4P43007 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC1A4P43007 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC1A4P43007 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC1A4P43007 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC1A4P43007 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC1A4P43007 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC1A4P43007 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC1A4P43007 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC1A4P43007 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC1A4P43007 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC1A4P43007 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC1A4P43007 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC1A4P43007 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC1A4P43007 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC1A4P43007 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC1A4P43007 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC1A4P43007 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC1A4P43007 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC1A4P43007 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SLC1A4P43007 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC1A4P43007 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC1A4P43007 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC1A4P43007 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC1A4P43007 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC1A4P43007 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC1A4P43007 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC1A4P43007 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC1A4P43007 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC1A4P43007 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC1A4P43007 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC1A4P43007 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC1A4P43007 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC1A4P43007 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SLC1A4P43007 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms