Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL35P42766 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL35P42766 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL35P42766 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL35P42766 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL35P42766 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL35P42766 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL35P42766 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL35P42766 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL35P42766 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL35P42766 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL35P42766 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL35P42766 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL35P42766 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL35P42766 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL35P42766 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL35P42766 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL35P42766 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL35P42766 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL35P42766 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL35P42766 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL35P42766 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL35P42766 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL35P42766 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL35P42766 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL35P42766 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL35P42766 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL35P42766 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL35P42766 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL35P42766 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL35P42766 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL35P42766 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL35P42766 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL35P42766 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL35P42766 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL35P42766 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL35P42766 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL35P42766 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL35P42766 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL35P42766 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL35P42766 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL35P42766 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL35P42766 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL35P42766 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL35P42766 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL35P42766 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL35P42766 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL35P42766 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL35P42766 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL35P42766 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL35P42766 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL35P42766 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL35P42766 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL35P42766 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL35P42766 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL35P42766 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL35P42766 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL35P42766 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPL35P42766 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPL35P42766 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPL35P42766 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL35P42766 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL35P42766 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL35P42766 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL35P42766 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL35P42766 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL35P42766 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL35P42766 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL35P42766 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL35P42766 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL35P42766 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL35P42766 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL35P42766 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL35P42766 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL35P42766 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL35P42766 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL35P42766 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL35P42766 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL35P42766 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL35P42766 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL35P42766 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL35P42766 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL35P42766 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL35P42766 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL35P42766 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL35P42766 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL35P42766 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL35P42766 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL35P42766 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL35P42766 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL35P42766 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL35P42766 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL35P42766 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL35P42766 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL35P42766 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL35P42766 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL35P42766 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL35P42766 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL35P42766 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL35P42766 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 617.7 ms