Protein–RNA interactions for Protein: P42356

PI4KA, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP42356 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PI4KAP42356 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PI4KAP42356 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PI4KAP42356 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PI4KAP42356 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PI4KAP42356 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PI4KAP42356 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PI4KAP42356 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PI4KAP42356 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PI4KAP42356 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PI4KAP42356 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PI4KAP42356 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PI4KAP42356 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PI4KAP42356 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PI4KAP42356 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PI4KAP42356 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PI4KAP42356 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PI4KAP42356 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PI4KAP42356 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PI4KAP42356 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PI4KAP42356 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PI4KAP42356 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PI4KAP42356 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PI4KAP42356 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PI4KAP42356 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PI4KAP42356 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PI4KAP42356 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PI4KAP42356 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PI4KAP42356 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PI4KAP42356 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PI4KAP42356 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PI4KAP42356 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PI4KAP42356 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PI4KAP42356 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PI4KAP42356 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PI4KAP42356 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PI4KAP42356 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PI4KAP42356 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PI4KAP42356 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PI4KAP42356 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PI4KAP42356 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PI4KAP42356 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PI4KAP42356 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PI4KAP42356 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PI4KAP42356 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PI4KAP42356 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PI4KAP42356 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PI4KAP42356 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PI4KAP42356 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PI4KAP42356 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PI4KAP42356 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PI4KAP42356 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PI4KAP42356 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PI4KAP42356 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PI4KAP42356 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PI4KAP42356 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PI4KAP42356 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PI4KAP42356 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PI4KAP42356 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PI4KAP42356 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms