Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFSF9P41273 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFSF9P41273 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFSF9P41273 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFSF9P41273 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFSF9P41273 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFSF9P41273 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFSF9P41273 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFSF9P41273 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFSF9P41273 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFSF9P41273 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFSF9P41273 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFSF9P41273 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFSF9P41273 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFSF9P41273 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFSF9P41273 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFSF9P41273 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFSF9P41273 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFSF9P41273 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFSF9P41273 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNFSF9P41273 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNFSF9P41273 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNFSF9P41273 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNFSF9P41273 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNFSF9P41273 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFSF9P41273 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFSF9P41273 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFSF9P41273 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFSF9P41273 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFSF9P41273 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFSF9P41273 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFSF9P41273 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFSF9P41273 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFSF9P41273 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFSF9P41273 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFSF9P41273 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFSF9P41273 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFSF9P41273 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFSF9P41273 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFSF9P41273 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFSF9P41273 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFSF9P41273 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFSF9P41273 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFSF9P41273 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFSF9P41273 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFSF9P41273 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFSF9P41273 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFSF9P41273 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFSF9P41273 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFSF9P41273 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFSF9P41273 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFSF9P41273 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFSF9P41273 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFSF9P41273 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFSF9P41273 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFSF9P41273 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFSF9P41273 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFSF9P41273 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFSF9P41273 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNFSF9P41273 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms