Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
KDM5CP41229 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
KDM5CP41229 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
KDM5CP41229 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
KDM5CP41229 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
KDM5CP41229 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
KDM5CP41229 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC36.27■■■■□ 3.4
KDM5CP41229 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
KDM5CP41229 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
KDM5CP41229 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
KDM5CP41229 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
KDM5CP41229 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.39
KDM5CP41229 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
KDM5CP41229 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
KDM5CP41229 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
KDM5CP41229 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
KDM5CP41229 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
KDM5CP41229 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
KDM5CP41229 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
KDM5CP41229 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
KDM5CP41229 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
KDM5CP41229 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
KDM5CP41229 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
KDM5CP41229 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
KDM5CP41229 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
KDM5CP41229 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
KDM5CP41229 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
KDM5CP41229 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
KDM5CP41229 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
KDM5CP41229 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
KDM5CP41229 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
KDM5CP41229 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.38
KDM5CP41229 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
KDM5CP41229 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
KDM5CP41229 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
KDM5CP41229 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
KDM5CP41229 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
KDM5CP41229 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
KDM5CP41229 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
KDM5CP41229 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
KDM5CP41229 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
KDM5CP41229 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
KDM5CP41229 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
KDM5CP41229 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
KDM5CP41229 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
KDM5CP41229 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
KDM5CP41229 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
KDM5CP41229 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
KDM5CP41229 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
KDM5CP41229 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
KDM5CP41229 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
KDM5CP41229 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
KDM5CP41229 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
KDM5CP41229 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
KDM5CP41229 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
KDM5CP41229 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
KDM5CP41229 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
KDM5CP41229 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
KDM5CP41229 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
KDM5CP41229 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
KDM5CP41229 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
KDM5CP41229 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
KDM5CP41229 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
KDM5CP41229 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
KDM5CP41229 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
KDM5CP41229 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC36.13■■■■□ 3.38
KDM5CP41229 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
KDM5CP41229 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
KDM5CP41229 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
KDM5CP41229 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
KDM5CP41229 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
KDM5CP41229 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
KDM5CP41229 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
KDM5CP41229 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
KDM5CP41229 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
KDM5CP41229 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
KDM5CP41229 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
KDM5CP41229 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
KDM5CP41229 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
KDM5CP41229 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
KDM5CP41229 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
KDM5CP41229 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
KDM5CP41229 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
KDM5CP41229 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
KDM5CP41229 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
KDM5CP41229 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
KDM5CP41229 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
KDM5CP41229 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
KDM5CP41229 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
KDM5CP41229 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
KDM5CP41229 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
KDM5CP41229 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
KDM5CP41229 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
KDM5CP41229 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
KDM5CP41229 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
KDM5CP41229 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
KDM5CP41229 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
KDM5CP41229 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
KDM5CP41229 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
KDM5CP41229 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms