Protein–RNA interactions for Protein: P41218

MNDA, Myeloid cell nuclear differentiation antigen, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNDAP41218 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MNDAP41218 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MNDAP41218 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MNDAP41218 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MNDAP41218 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MNDAP41218 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MNDAP41218 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MNDAP41218 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MNDAP41218 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MNDAP41218 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MNDAP41218 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MNDAP41218 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MNDAP41218 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MNDAP41218 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MNDAP41218 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MNDAP41218 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MNDAP41218 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MNDAP41218 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MNDAP41218 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MNDAP41218 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MNDAP41218 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MNDAP41218 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MNDAP41218 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MNDAP41218 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MNDAP41218 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MNDAP41218 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MNDAP41218 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MNDAP41218 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MNDAP41218 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MNDAP41218 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MNDAP41218 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MNDAP41218 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MNDAP41218 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MNDAP41218 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MNDAP41218 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MNDAP41218 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MNDAP41218 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MNDAP41218 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MNDAP41218 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MNDAP41218 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MNDAP41218 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MNDAP41218 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MNDAP41218 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MNDAP41218 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MNDAP41218 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MNDAP41218 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MNDAP41218 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MNDAP41218 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MNDAP41218 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MNDAP41218 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MNDAP41218 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MNDAP41218 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MNDAP41218 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MNDAP41218 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MNDAP41218 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MNDAP41218 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MNDAP41218 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MNDAP41218 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MNDAP41218 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MNDAP41218 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MNDAP41218 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MNDAP41218 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MNDAP41218 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MNDAP41218 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MNDAP41218 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MNDAP41218 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MNDAP41218 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MNDAP41218 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MNDAP41218 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MNDAP41218 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MNDAP41218 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MNDAP41218 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MNDAP41218 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MNDAP41218 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MNDAP41218 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MNDAP41218 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MNDAP41218 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MNDAP41218 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MNDAP41218 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MNDAP41218 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MNDAP41218 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MNDAP41218 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MNDAP41218 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MNDAP41218 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MNDAP41218 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MNDAP41218 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MNDAP41218 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MNDAP41218 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MNDAP41218 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MNDAP41218 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MNDAP41218 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MNDAP41218 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MNDAP41218 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MNDAP41218 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MNDAP41218 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MNDAP41218 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MNDAP41218 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MNDAP41218 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MNDAP41218 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MNDAP41218 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms