Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PBX1P40424 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PBX1P40424 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PBX1P40424 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PBX1P40424 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PBX1P40424 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PBX1P40424 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PBX1P40424 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PBX1P40424 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PBX1P40424 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PBX1P40424 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PBX1P40424 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PBX1P40424 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PBX1P40424 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PBX1P40424 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PBX1P40424 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PBX1P40424 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PBX1P40424 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PBX1P40424 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PBX1P40424 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PBX1P40424 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PBX1P40424 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PBX1P40424 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PBX1P40424 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PBX1P40424 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PBX1P40424 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PBX1P40424 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PBX1P40424 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PBX1P40424 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PBX1P40424 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PBX1P40424 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PBX1P40424 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PBX1P40424 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PBX1P40424 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PBX1P40424 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PBX1P40424 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PBX1P40424 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PBX1P40424 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PBX1P40424 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PBX1P40424 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PBX1P40424 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PBX1P40424 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PBX1P40424 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PBX1P40424 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PBX1P40424 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PBX1P40424 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PBX1P40424 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PBX1P40424 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PBX1P40424 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PBX1P40424 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PBX1P40424 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PBX1P40424 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PBX1P40424 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PBX1P40424 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PBX1P40424 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PBX1P40424 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PBX1P40424 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PBX1P40424 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PBX1P40424 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PBX1P40424 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PBX1P40424 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PBX1P40424 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PBX1P40424 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PBX1P40424 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PBX1P40424 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PBX1P40424 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PBX1P40424 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PBX1P40424 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PBX1P40424 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PBX1P40424 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PBX1P40424 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PBX1P40424 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PBX1P40424 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PBX1P40424 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PBX1P40424 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PBX1P40424 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PBX1P40424 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PBX1P40424 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PBX1P40424 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PBX1P40424 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PBX1P40424 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PBX1P40424 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PBX1P40424 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PBX1P40424 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PBX1P40424 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PBX1P40424 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PBX1P40424 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PBX1P40424 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PBX1P40424 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PBX1P40424 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PBX1P40424 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PBX1P40424 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PBX1P40424 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PBX1P40424 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PBX1P40424 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PBX1P40424 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PBX1P40424 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PBX1P40424 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PBX1P40424 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PBX1P40424 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms