Protein–RNA interactions for Protein: P37023

ACVRL1, Serine/threonine-protein kinase receptor R3, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVRL1P37023 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACVRL1P37023 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACVRL1P37023 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACVRL1P37023 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ACVRL1P37023 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACVRL1P37023 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACVRL1P37023 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms