Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BMI1P35226 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BMI1P35226 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BMI1P35226 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BMI1P35226 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BMI1P35226 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BMI1P35226 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BMI1P35226 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BMI1P35226 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BMI1P35226 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BMI1P35226 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BMI1P35226 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BMI1P35226 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BMI1P35226 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BMI1P35226 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BMI1P35226 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BMI1P35226 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BMI1P35226 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BMI1P35226 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BMI1P35226 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BMI1P35226 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BMI1P35226 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BMI1P35226 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BMI1P35226 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BMI1P35226 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BMI1P35226 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BMI1P35226 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BMI1P35226 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BMI1P35226 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BMI1P35226 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
BMI1P35226 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BMI1P35226 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BMI1P35226 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BMI1P35226 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMI1P35226 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMI1P35226 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BMI1P35226 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMI1P35226 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMI1P35226 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMI1P35226 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMI1P35226 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMI1P35226 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMI1P35226 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMI1P35226 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BMI1P35226 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BMI1P35226 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BMI1P35226 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BMI1P35226 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BMI1P35226 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BMI1P35226 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BMI1P35226 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BMI1P35226 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BMI1P35226 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BMI1P35226 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BMI1P35226 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BMI1P35226 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BMI1P35226 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BMI1P35226 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BMI1P35226 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BMI1P35226 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BMI1P35226 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BMI1P35226 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BMI1P35226 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BMI1P35226 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BMI1P35226 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BMI1P35226 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BMI1P35226 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BMI1P35226 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BMI1P35226 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BMI1P35226 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BMI1P35226 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BMI1P35226 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMI1P35226 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMI1P35226 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMI1P35226 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMI1P35226 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMI1P35226 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMI1P35226 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BMI1P35226 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BMI1P35226 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BMI1P35226 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BMI1P35226 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BMI1P35226 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BMI1P35226 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BMI1P35226 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BMI1P35226 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BMI1P35226 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BMI1P35226 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BMI1P35226 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BMI1P35226 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BMI1P35226 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BMI1P35226 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BMI1P35226 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BMI1P35226 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BMI1P35226 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BMI1P35226 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BMI1P35226 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BMI1P35226 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BMI1P35226 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMI1P35226 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms