Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER1P34995 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms