Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RPL9P32969 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RPL9P32969 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPL9P32969 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RPL9P32969 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPL9P32969 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPL9P32969 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPL9P32969 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPL9P32969 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPL9P32969 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPL9P32969 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPL9P32969 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPL9P32969 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPL9P32969 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPL9P32969 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPL9P32969 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPL9P32969 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RPL9P32969 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RPL9P32969 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPL9P32969 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPL9P32969 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPL9P32969 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPL9P32969 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPL9P32969 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPL9P32969 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPL9P32969 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPL9P32969 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPL9P32969 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPL9P32969 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPL9P32969 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPL9P32969 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPL9P32969 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPL9P32969 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPL9P32969 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPL9P32969 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RPL9P32969 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPL9P32969 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RPL9P32969 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RPL9P32969 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPL9P32969 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPL9P32969 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPL9P32969 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPL9P32969 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPL9P32969 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPL9P32969 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPL9P32969 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPL9P32969 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPL9P32969 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPL9P32969 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPL9P32969 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPL9P32969 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPL9P32969 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPL9P32969 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPL9P32969 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RPL9P32969 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPL9P32969 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPL9P32969 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RPL9P32969 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RPL9P32969 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPL9P32969 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPL9P32969 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL9P32969 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL9P32969 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL9P32969 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL9P32969 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL9P32969 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL9P32969 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL9P32969 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL9P32969 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL9P32969 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL9P32969 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL9P32969 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL9P32969 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL9P32969 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RPL9P32969 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RPL9P32969 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPL9P32969 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPL9P32969 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPL9P32969 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPL9P32969 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPL9P32969 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPL9P32969 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPL9P32969 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RPL9P32969 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPL9P32969 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPL9P32969 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPL9P32969 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPL9P32969 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPL9P32969 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPL9P32969 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPL9P32969 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPL9P32969 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPL9P32969 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPL9P32969 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPL9P32969 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPL9P32969 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPL9P32969 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL9P32969 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL9P32969 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL9P32969 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms