Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC8A1P32418 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC8A1P32418 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC8A1P32418 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC8A1P32418 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC8A1P32418 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC8A1P32418 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC8A1P32418 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC8A1P32418 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC8A1P32418 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC8A1P32418 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC8A1P32418 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC8A1P32418 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC8A1P32418 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC8A1P32418 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC8A1P32418 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC8A1P32418 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC8A1P32418 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC8A1P32418 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC8A1P32418 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC8A1P32418 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC8A1P32418 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC8A1P32418 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC8A1P32418 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC8A1P32418 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC8A1P32418 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC8A1P32418 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC8A1P32418 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC8A1P32418 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC8A1P32418 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC8A1P32418 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC8A1P32418 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC8A1P32418 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC8A1P32418 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC8A1P32418 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC8A1P32418 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC8A1P32418 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC8A1P32418 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC8A1P32418 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms