Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCKARP32238 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCKARP32238 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCKARP32238 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCKARP32238 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCKARP32238 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCKARP32238 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCKARP32238 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCKARP32238 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCKARP32238 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCKARP32238 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCKARP32238 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCKARP32238 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCKARP32238 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCKARP32238 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCKARP32238 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCKARP32238 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCKARP32238 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCKARP32238 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCKARP32238 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCKARP32238 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCKARP32238 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCKARP32238 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCKARP32238 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCKARP32238 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCKARP32238 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCKARP32238 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCKARP32238 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCKARP32238 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCKARP32238 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCKARP32238 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCKARP32238 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCKARP32238 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCKARP32238 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCKARP32238 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCKARP32238 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCKARP32238 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCKARP32238 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCKARP32238 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCKARP32238 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCKARP32238 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCKARP32238 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCKARP32238 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCKARP32238 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCKARP32238 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCKARP32238 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCKARP32238 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCKARP32238 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCKARP32238 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCKARP32238 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCKARP32238 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCKARP32238 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCKARP32238 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCKARP32238 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCKARP32238 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCKARP32238 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCKARP32238 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCKARP32238 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCKARP32238 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCKARP32238 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCKARP32238 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCKARP32238 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCKARP32238 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCKARP32238 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCKARP32238 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCKARP32238 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCKARP32238 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCKARP32238 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCKARP32238 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCKARP32238 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCKARP32238 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCKARP32238 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCKARP32238 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCKARP32238 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCKARP32238 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCKARP32238 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCKARP32238 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCKARP32238 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCKARP32238 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCKARP32238 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCKARP32238 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCKARP32238 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCKARP32238 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCKARP32238 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCKARP32238 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCKARP32238 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCKARP32238 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCKARP32238 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCKARP32238 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCKARP32238 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCKARP32238 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCKARP32238 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCKARP32238 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCKARP32238 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCKARP32238 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCKARP32238 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCKARP32238 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCKARP32238 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCKARP32238 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCKARP32238 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms