Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GJB2P29033 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GJB2P29033 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJB2P29033 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJB2P29033 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJB2P29033 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJB2P29033 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GJB2P29033 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJB2P29033 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJB2P29033 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJB2P29033 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJB2P29033 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJB2P29033 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJB2P29033 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJB2P29033 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJB2P29033 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJB2P29033 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJB2P29033 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJB2P29033 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJB2P29033 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GJB2P29033 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GJB2P29033 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GJB2P29033 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
GJB2P29033 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GJB2P29033 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GJB2P29033 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJB2P29033 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJB2P29033 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJB2P29033 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJB2P29033 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJB2P29033 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GJB2P29033 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GJB2P29033 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GJB2P29033 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GJB2P29033 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GJB2P29033 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GJB2P29033 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJB2P29033 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJB2P29033 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GJB2P29033 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJB2P29033 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJB2P29033 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJB2P29033 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJB2P29033 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJB2P29033 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJB2P29033 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJB2P29033 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJB2P29033 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJB2P29033 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJB2P29033 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJB2P29033 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJB2P29033 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJB2P29033 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJB2P29033 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJB2P29033 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJB2P29033 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJB2P29033 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJB2P29033 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJB2P29033 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJB2P29033 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJB2P29033 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJB2P29033 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJB2P29033 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GJB2P29033 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GJB2P29033 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GJB2P29033 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJB2P29033 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJB2P29033 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJB2P29033 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJB2P29033 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJB2P29033 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJB2P29033 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJB2P29033 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJB2P29033 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJB2P29033 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJB2P29033 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJB2P29033 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJB2P29033 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJB2P29033 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GJB2P29033 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJB2P29033 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJB2P29033 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJB2P29033 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJB2P29033 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJB2P29033 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJB2P29033 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJB2P29033 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJB2P29033 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJB2P29033 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJB2P29033 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJB2P29033 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJB2P29033 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJB2P29033 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJB2P29033 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJB2P29033 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJB2P29033 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJB2P29033 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJB2P29033 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJB2P29033 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJB2P29033 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms