Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTFP26441 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTFP26441 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTFP26441 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTFP26441 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTFP26441 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTFP26441 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTFP26441 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTFP26441 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTFP26441 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTFP26441 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTFP26441 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTFP26441 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTFP26441 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTFP26441 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTFP26441 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTFP26441 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTFP26441 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTFP26441 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTFP26441 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTFP26441 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTFP26441 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTFP26441 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTFP26441 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTFP26441 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTFP26441 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTFP26441 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTFP26441 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTFP26441 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTFP26441 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTFP26441 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTFP26441 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTFP26441 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTFP26441 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTFP26441 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTFP26441 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTFP26441 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTFP26441 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTFP26441 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNTFP26441 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNTFP26441 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTFP26441 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTFP26441 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTFP26441 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTFP26441 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTFP26441 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTFP26441 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTFP26441 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTFP26441 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTFP26441 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTFP26441 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTFP26441 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTFP26441 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTFP26441 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTFP26441 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTFP26441 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTFP26441 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTFP26441 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTFP26441 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTFP26441 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTFP26441 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTFP26441 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTFP26441 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTFP26441 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTFP26441 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTFP26441 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTFP26441 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTFP26441 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTFP26441 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTFP26441 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTFP26441 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTFP26441 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTFP26441 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTFP26441 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTFP26441 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTFP26441 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTFP26441 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTFP26441 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTFP26441 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTFP26441 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTFP26441 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTFP26441 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTFP26441 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTFP26441 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTFP26441 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTFP26441 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTFP26441 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTFP26441 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTFP26441 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTFP26441 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTFP26441 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTFP26441 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTFP26441 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTFP26441 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTFP26441 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTFP26441 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTFP26441 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTFP26441 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTFP26441 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTFP26441 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.4 ms