Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CTSSP25774 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSSP25774 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSSP25774 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSSP25774 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTSSP25774 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTSSP25774 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTSSP25774 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTSSP25774 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSSP25774 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSSP25774 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTSSP25774 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSSP25774 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSSP25774 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSSP25774 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTSSP25774 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CTSSP25774 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CTSSP25774 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSSP25774 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSSP25774 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTSSP25774 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTSSP25774 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CTSSP25774 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CTSSP25774 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTSSP25774 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTSSP25774 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTSSP25774 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTSSP25774 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTSSP25774 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTSSP25774 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTSSP25774 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTSSP25774 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTSSP25774 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CTSSP25774 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTSSP25774 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTSSP25774 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTSSP25774 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTSSP25774 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTSSP25774 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSSP25774 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSSP25774 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSSP25774 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSSP25774 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSSP25774 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSSP25774 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSSP25774 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSSP25774 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSSP25774 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSSP25774 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSSP25774 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSSP25774 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSSP25774 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSSP25774 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSSP25774 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSSP25774 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSSP25774 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSSP25774 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSSP25774 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSSP25774 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSSP25774 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSSP25774 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSSP25774 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSSP25774 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSSP25774 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSSP25774 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSSP25774 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSSP25774 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSSP25774 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSSP25774 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTSSP25774 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTSSP25774 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTSSP25774 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTSSP25774 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTSSP25774 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTSSP25774 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTSSP25774 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTSSP25774 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTSSP25774 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTSSP25774 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTSSP25774 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTSSP25774 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTSSP25774 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTSSP25774 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTSSP25774 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CTSSP25774 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTSSP25774 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTSSP25774 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTSSP25774 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CTSSP25774 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTSSP25774 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTSSP25774 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTSSP25774 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTSSP25774 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTSSP25774 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTSSP25774 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CTSSP25774 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CTSSP25774 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTSSP25774 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTSSP25774 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CTSSP25774 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms