Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TNFSF4P23510 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms