Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRDP23468 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRDP23468 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRDP23468 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRDP23468 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRDP23468 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRDP23468 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRDP23468 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRDP23468 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRDP23468 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRDP23468 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRDP23468 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRDP23468 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRDP23468 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRDP23468 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRDP23468 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRDP23468 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRDP23468 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRDP23468 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRDP23468 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRDP23468 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRDP23468 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRDP23468 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRDP23468 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRDP23468 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRDP23468 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRDP23468 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRDP23468 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRDP23468 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRDP23468 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRDP23468 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRDP23468 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRDP23468 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRDP23468 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRDP23468 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRDP23468 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTPRDP23468 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRDP23468 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRDP23468 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRDP23468 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRDP23468 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRDP23468 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRDP23468 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRDP23468 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRDP23468 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRDP23468 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRDP23468 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRDP23468 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRDP23468 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRDP23468 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRDP23468 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRDP23468 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRDP23468 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRDP23468 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRDP23468 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRDP23468 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRDP23468 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRDP23468 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRDP23468 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRDP23468 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
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