Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MYF6P23409 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYF6P23409 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYF6P23409 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYF6P23409 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYF6P23409 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYF6P23409 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYF6P23409 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYF6P23409 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYF6P23409 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYF6P23409 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MYF6P23409 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MYF6P23409 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MYF6P23409 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MYF6P23409 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MYF6P23409 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MYF6P23409 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MYF6P23409 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MYF6P23409 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYF6P23409 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYF6P23409 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYF6P23409 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYF6P23409 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYF6P23409 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYF6P23409 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MYF6P23409 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYF6P23409 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYF6P23409 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYF6P23409 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYF6P23409 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYF6P23409 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYF6P23409 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYF6P23409 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYF6P23409 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYF6P23409 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYF6P23409 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYF6P23409 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYF6P23409 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYF6P23409 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYF6P23409 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYF6P23409 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYF6P23409 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYF6P23409 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYF6P23409 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYF6P23409 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYF6P23409 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYF6P23409 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYF6P23409 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYF6P23409 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYF6P23409 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYF6P23409 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYF6P23409 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYF6P23409 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYF6P23409 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYF6P23409 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYF6P23409 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYF6P23409 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYF6P23409 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYF6P23409 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYF6P23409 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYF6P23409 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYF6P23409 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYF6P23409 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYF6P23409 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYF6P23409 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYF6P23409 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYF6P23409 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYF6P23409 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYF6P23409 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYF6P23409 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYF6P23409 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYF6P23409 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYF6P23409 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYF6P23409 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYF6P23409 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYF6P23409 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYF6P23409 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYF6P23409 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYF6P23409 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYF6P23409 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYF6P23409 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYF6P23409 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYF6P23409 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYF6P23409 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYF6P23409 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYF6P23409 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYF6P23409 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYF6P23409 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYF6P23409 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYF6P23409 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYF6P23409 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYF6P23409 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MYF6P23409 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYF6P23409 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYF6P23409 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYF6P23409 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MYF6P23409 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MYF6P23409 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MYF6P23409 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MYF6P23409 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms