Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF6P18850 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF6P18850 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF6P18850 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF6P18850 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF6P18850 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF6P18850 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF6P18850 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF6P18850 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF6P18850 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF6P18850 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF6P18850 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF6P18850 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATF6P18850 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATF6P18850 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATF6P18850 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATF6P18850 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATF6P18850 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATF6P18850 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATF6P18850 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATF6P18850 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATF6P18850 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATF6P18850 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATF6P18850 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATF6P18850 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATF6P18850 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATF6P18850 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF6P18850 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF6P18850 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF6P18850 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF6P18850 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF6P18850 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF6P18850 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF6P18850 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF6P18850 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF6P18850 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF6P18850 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF6P18850 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF6P18850 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF6P18850 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF6P18850 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF6P18850 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF6P18850 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF6P18850 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF6P18850 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF6P18850 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF6P18850 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF6P18850 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF6P18850 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF6P18850 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF6P18850 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF6P18850 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF6P18850 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF6P18850 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF6P18850 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATF6P18850 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATF6P18850 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATF6P18850 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATF6P18850 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF6P18850 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF6P18850 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF6P18850 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF6P18850 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF6P18850 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF6P18850 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF6P18850 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF6P18850 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF6P18850 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF6P18850 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF6P18850 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF6P18850 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF6P18850 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF6P18850 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF6P18850 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF6P18850 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF6P18850 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF6P18850 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF6P18850 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF6P18850 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF6P18850 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF6P18850 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF6P18850 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF6P18850 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF6P18850 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF6P18850 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF6P18850 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF6P18850 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF6P18850 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF6P18850 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF6P18850 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF6P18850 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF6P18850 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF6P18850 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF6P18850 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF6P18850 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF6P18850 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF6P18850 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF6P18850 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF6P18850 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF6P18850 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms