Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPB42P16452 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPB42P16452 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPB42P16452 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPB42P16452 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPB42P16452 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPB42P16452 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPB42P16452 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPB42P16452 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPB42P16452 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPB42P16452 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPB42P16452 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPB42P16452 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPB42P16452 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPB42P16452 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPB42P16452 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPB42P16452 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPB42P16452 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPB42P16452 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPB42P16452 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPB42P16452 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPB42P16452 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPB42P16452 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPB42P16452 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPB42P16452 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPB42P16452 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPB42P16452 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPB42P16452 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPB42P16452 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPB42P16452 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPB42P16452 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPB42P16452 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPB42P16452 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPB42P16452 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPB42P16452 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPB42P16452 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPB42P16452 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPB42P16452 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPB42P16452 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPB42P16452 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EPB42P16452 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPB42P16452 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPB42P16452 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPB42P16452 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPB42P16452 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPB42P16452 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPB42P16452 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPB42P16452 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPB42P16452 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPB42P16452 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPB42P16452 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPB42P16452 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPB42P16452 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPB42P16452 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPB42P16452 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPB42P16452 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EPB42P16452 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPB42P16452 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPB42P16452 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPB42P16452 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EPB42P16452 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EPB42P16452 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EPB42P16452 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPB42P16452 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EPB42P16452 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPB42P16452 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPB42P16452 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPB42P16452 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPB42P16452 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPB42P16452 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPB42P16452 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPB42P16452 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPB42P16452 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPB42P16452 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPB42P16452 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPB42P16452 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPB42P16452 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPB42P16452 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPB42P16452 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPB42P16452 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPB42P16452 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPB42P16452 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPB42P16452 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPB42P16452 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPB42P16452 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPB42P16452 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPB42P16452 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPB42P16452 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPB42P16452 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPB42P16452 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPB42P16452 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPB42P16452 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EPB42P16452 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPB42P16452 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPB42P16452 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPB42P16452 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPB42P16452 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPB42P16452 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPB42P16452 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EPB42P16452 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms