Protein–RNA interactions for Protein: P15328

FOLR1, Folate receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR1P15328 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOLR1P15328 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOLR1P15328 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOLR1P15328 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms