Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFTPCP11686 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFTPCP11686 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
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