Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD28P10747 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD28P10747 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD28P10747 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD28P10747 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD28P10747 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD28P10747 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD28P10747 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD28P10747 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD28P10747 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD28P10747 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD28P10747 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD28P10747 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD28P10747 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD28P10747 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD28P10747 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD28P10747 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD28P10747 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD28P10747 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD28P10747 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD28P10747 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD28P10747 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD28P10747 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD28P10747 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD28P10747 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD28P10747 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD28P10747 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD28P10747 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD28P10747 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD28P10747 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD28P10747 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD28P10747 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD28P10747 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD28P10747 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD28P10747 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD28P10747 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD28P10747 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD28P10747 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD28P10747 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD28P10747 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD28P10747 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD28P10747 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD28P10747 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD28P10747 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD28P10747 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD28P10747 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CD28P10747 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CD28P10747 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CD28P10747 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CD28P10747 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD28P10747 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD28P10747 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD28P10747 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD28P10747 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD28P10747 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD28P10747 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD28P10747 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD28P10747 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD28P10747 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD28P10747 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD28P10747 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CD28P10747 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD28P10747 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD28P10747 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD28P10747 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD28P10747 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD28P10747 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD28P10747 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD28P10747 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CD28P10747 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD28P10747 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD28P10747 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD28P10747 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD28P10747 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD28P10747 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD28P10747 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD28P10747 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD28P10747 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD28P10747 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD28P10747 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD28P10747 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD28P10747 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD28P10747 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD28P10747 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD28P10747 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD28P10747 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD28P10747 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD28P10747 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD28P10747 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CD28P10747 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD28P10747 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD28P10747 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD28P10747 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CD28P10747 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD28P10747 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD28P10747 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CD28P10747 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD28P10747 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD28P10747 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD28P10747 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms