Protein–RNA interactions for Protein: P10451

SPP1, Osteopontin, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP1P10451 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPP1P10451 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPP1P10451 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPP1P10451 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPP1P10451 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPP1P10451 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPP1P10451 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPP1P10451 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPP1P10451 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPP1P10451 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPP1P10451 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPP1P10451 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPP1P10451 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPP1P10451 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPP1P10451 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPP1P10451 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPP1P10451 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPP1P10451 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPP1P10451 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPP1P10451 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPP1P10451 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPP1P10451 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPP1P10451 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPP1P10451 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPP1P10451 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPP1P10451 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPP1P10451 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPP1P10451 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPP1P10451 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPP1P10451 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPP1P10451 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPP1P10451 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPP1P10451 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPP1P10451 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPP1P10451 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPP1P10451 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPP1P10451 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPP1P10451 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPP1P10451 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPP1P10451 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SPP1P10451 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPP1P10451 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPP1P10451 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPP1P10451 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPP1P10451 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPP1P10451 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPP1P10451 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPP1P10451 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPP1P10451 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPP1P10451 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPP1P10451 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SPP1P10451 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPP1P10451 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPP1P10451 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPP1P10451 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPP1P10451 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPP1P10451 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPP1P10451 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPP1P10451 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPP1P10451 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPP1P10451 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPP1P10451 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPP1P10451 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPP1P10451 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPP1P10451 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPP1P10451 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPP1P10451 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPP1P10451 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPP1P10451 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPP1P10451 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPP1P10451 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPP1P10451 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPP1P10451 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPP1P10451 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPP1P10451 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPP1P10451 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPP1P10451 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPP1P10451 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPP1P10451 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SPP1P10451 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPP1P10451 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPP1P10451 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPP1P10451 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPP1P10451 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPP1P10451 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPP1P10451 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPP1P10451 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPP1P10451 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPP1P10451 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPP1P10451 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPP1P10451 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPP1P10451 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPP1P10451 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPP1P10451 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPP1P10451 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPP1P10451 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SPP1P10451 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPP1P10451 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPP1P10451 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPP1P10451 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms