Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSIG8P0DPA2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSIG8P0DPA2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms