Protein–RNA interactions for Protein: P0DMP2

SRGAP2B, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2BP0DMP2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRGAP2BP0DMP2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRGAP2BP0DMP2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRGAP2BP0DMP2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRGAP2BP0DMP2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SRGAP2BP0DMP2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRGAP2BP0DMP2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SRGAP2BP0DMP2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRGAP2BP0DMP2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRGAP2BP0DMP2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRGAP2BP0DMP2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRGAP2BP0DMP2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRGAP2BP0DMP2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRGAP2BP0DMP2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRGAP2BP0DMP2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRGAP2BP0DMP2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SRGAP2BP0DMP2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRGAP2BP0DMP2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRGAP2BP0DMP2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRGAP2BP0DMP2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRGAP2BP0DMP2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRGAP2BP0DMP2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRGAP2BP0DMP2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SRGAP2BP0DMP2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRGAP2BP0DMP2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRGAP2BP0DMP2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SRGAP2BP0DMP2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SRGAP2BP0DMP2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRGAP2BP0DMP2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRGAP2BP0DMP2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRGAP2BP0DMP2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRGAP2BP0DMP2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRGAP2BP0DMP2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRGAP2BP0DMP2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SRGAP2BP0DMP2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRGAP2BP0DMP2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRGAP2BP0DMP2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRGAP2BP0DMP2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRGAP2BP0DMP2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRGAP2BP0DMP2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRGAP2BP0DMP2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRGAP2BP0DMP2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRGAP2BP0DMP2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRGAP2BP0DMP2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRGAP2BP0DMP2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRGAP2BP0DMP2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRGAP2BP0DMP2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRGAP2BP0DMP2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRGAP2BP0DMP2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRGAP2BP0DMP2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRGAP2BP0DMP2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRGAP2BP0DMP2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRGAP2BP0DMP2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRGAP2BP0DMP2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRGAP2BP0DMP2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRGAP2BP0DMP2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRGAP2BP0DMP2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRGAP2BP0DMP2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRGAP2BP0DMP2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SRGAP2BP0DMP2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRGAP2BP0DMP2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRGAP2BP0DMP2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRGAP2BP0DMP2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRGAP2BP0DMP2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms