Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SRGAP2CP0DJJ0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SRGAP2CP0DJJ0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SRGAP2CP0DJJ0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SRGAP2CP0DJJ0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SRGAP2CP0DJJ0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SRGAP2CP0DJJ0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SRGAP2CP0DJJ0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRGAP2CP0DJJ0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRGAP2CP0DJJ0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRGAP2CP0DJJ0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRGAP2CP0DJJ0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRGAP2CP0DJJ0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRGAP2CP0DJJ0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SRGAP2CP0DJJ0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SRGAP2CP0DJJ0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRGAP2CP0DJJ0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SRGAP2CP0DJJ0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SRGAP2CP0DJJ0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRGAP2CP0DJJ0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SRGAP2CP0DJJ0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRGAP2CP0DJJ0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SRGAP2CP0DJJ0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRGAP2CP0DJJ0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRGAP2CP0DJJ0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRGAP2CP0DJJ0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP2CP0DJJ0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP2CP0DJJ0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP2CP0DJJ0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP2CP0DJJ0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP2CP0DJJ0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP2CP0DJJ0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP2CP0DJJ0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP2CP0DJJ0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP2CP0DJJ0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP2CP0DJJ0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP2CP0DJJ0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP2CP0DJJ0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP2CP0DJJ0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP2CP0DJJ0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP2CP0DJJ0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP2CP0DJJ0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP2CP0DJJ0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRGAP2CP0DJJ0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRGAP2CP0DJJ0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRGAP2CP0DJJ0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRGAP2CP0DJJ0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRGAP2CP0DJJ0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRGAP2CP0DJJ0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRGAP2CP0DJJ0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRGAP2CP0DJJ0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRGAP2CP0DJJ0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms