Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMIM6P0DI80 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM6P0DI80 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.7 ms